В ГБУЗ «ВОКНД» в стационарном режиме функционируют 12 отделений. Шесть из них, расположены в Тракторозаводском районе по адресу ул. Дегтярева 8, в том числе отделение неотложной наркологической помощи, отделение медицинской реабилитации для лиц с наркологическими расстройствами и наркологическое отделение для несовершеннолетних.

С целью повышения доступности специализированной наркологической помощи и медицинской реабилитации пациентам, в Красноармейском районе открыто стационарное отделение № 2 и отделение медицинской реабилитации для лиц с наркологическими расстройствами для несовершеннолетних по адресу ул. Арсеньева 10.

В Волжском Волгоградской области с июня 2020 года функционирует отделение неотложной наркологической помощи, отделение медицинской реабилитации для лиц с наркологическими расстройствами по адресу: Волжский, ул. Пушкина 45/1.

В Урюпинске Волгоградской области с июля 2021 года функционирует отделение неотложной наркологической помощи по адресу: Урюпинск, ул. Лизы Чайкиной, 8.

В Михайловке Волгоградской области с июля 2021 года функционирует отделение неотложной наркологической помощи по адресу: Михайловка, ул. Пирогова. 82.

Стационарная служба ГБУЗ «ВОКНД» курируется заместителем главного врача по медицинской части и главной медицинской сестрой.